Trường THCS Lý Tự Trọng được thành lập từ mùa thu 1985 theo quyết địnhcủa UBND Thành Phố Biên Hòa  ngày 15 tháng 8 năm 1985. Tiền thân là trường cấp 1, 2 Hố Nai 2D Trường được nằm trên thửa đất thuộc địa phận xã Hố Nai 2 trước đây và hiện nay là khu phố 5A – phường Tân Biên –Tp Biên Hòa – Đồng Nai với diện tích 9000m². Khi mới thành lập trường có 14 lớp – 32 cán bộ, giáo viên, nhân viên do thầy Phạm Kim Khôi làm hiệu trưởng. Đến năm 2001, được sự quan tâm của các cấp ủy Đảng, chính quyền và lãnh đạo của ngành giáo dục đã cho xây dựng lại mới kiên cố gồm 1 dãy 2 tầng cho khối hành chính, 1 dãy 3 tầng gồm 17phòng học và hội trường 80 chỗ, 1 dãy 2 tầng gồm các phòng chức năng phục vụ công tác dạy và học của nhà trường. Với sự tăng dân số cơ học trong giai đoạn này, nhà trường phải mượn thêm cơ sở của trường mẫu giáo Tân Biên để đáp ứng được con em nhân dân có chỗ học tập trên địa bàn phường Tân Biên và các phường lân cận. Giai đoạn này cũng chính là đỉnh cao về thành tích dạy và học của nhà trường. Năm học2000-2001 được Thủ tướng Chính phủ tặng bằng khen. Đây là thành tích cao nhất trong 30 năm qua.Đến năm 2007 nhà nước đầu tư xây dựng 2 trường THCS Võ Trường Toản thuộc phường Tân Hòa và THCS Bùi Hữu Nghĩa thuộc phường Hố Nai. Do đó số học sinh được tách về hai trường và đội ngũ giáo viên cũng được phân công vềhai trường mới. Lúc này trường THCS Lý Tự Trọng gồm 75 cán bộ - giáo viên – công nhân viên, có 32 lớp (mỗi khối 8 lớp). Tổng số học sinh : 1275 học sinh và từ đây trường bắt đầu xây dựng và hoàn thiện đạt chuẩn quốc gia năm 2009. Năm 2014 chào mừng kỷ niệm 100 năm ngày sinh anh hùng Lý Tự Trọng, nhà trường cùng Ban đại diện cha mẹ học sinh xây dựng tượng đài anh hùng Lý Tự Trọng nhằm giáo dục truyền thốngđạo đức và lý tưởng Cách mạng cho học sinh đồng thời cũng là nơi để nhà trường báo công mỗi khi đạt được những thành tích cao trong phong trào dạy tốt- học tốt.

Hơn một phần tư thế kỷ, các thế hệ thầy và trò trường THCS Lý Tự Trọng đã luôn phát huy tinh thần thi đua dạy tốt – học tốt trong mọi điều kiện thực tiễn của nhà trường để lớp lớp thế hệ học sinh của trường trở thành những công dân có ích cho xã hội. Từngôi trường thân yêu này, hàng vạn học sinh đã tỏa đi khắp mọi miền Tổ quốc, có rất nhiều học sinh du học và sinh sống tại Úc, Mỹ, Canada, …. Nhiều học sinh trở thành cán bộ quản lý, tiến sĩ, kỹ sư, bác sĩ, nhà giáo, … nhà doanh nghiệp giỏi hoặc trực tiếp lao động sản xuất trên các lĩnh vực của cuộc sống góp phần không nhỏ vào sự phát triển đi lên của địa phương cũng như của xã hội nói chung. Hiện nay để cùng bắt nhiệp với sự phát triển của đất nước, thầy và trò trường THCS Lý Tự Trọng phát huy truyền thống tốt đẹp của nhà trường, noi gương lớp lớp các thầy cô giáo, các anh chị học sinh đi trước. Quyết tâm thực hiện đổi mới toàn diện giáo dục và đào tạo theo tinh thần nghị quyết 29 của BCHTW lần 8 khóa XI nhằm xây dựng nhà trường vững mạnh trong thời gian tiếp theo.

                                                                                                                                    HIỆU TRƯỞNG

                                                                                                                                    LÊ VINH TOAN